Sejak berdiri sampai sekarang SMA Negeri 1 Nabire Papua telah menjali kerja sama baik dengan sesama Dinas Pendidikan Kabupaten maupun Provinsi Papua dan juga dengan pihak-pihak terkait demi menunjang optimalisasi proses belajar mengajar. Berikut ini adalah kerjasama yang dijalin antara lain dengan :
-
MKKS SMA Wilayah .....
-
Prakerin dengan beberapa Industri barang dan Jasa yang digunakan selama Prakerin Siswa
-
PT Telkom akses Indihom Internet
-
Dinas Pendidikan sebagai Kabupaten Nabire
-
PPAD Provinsi Papua di Jayapura